Covid, dagli Stati Uniti arriva un test che riconosce le varianti in poche ore

I ricercatori dell'UT Southwestern Medical Center di Dallas hanno annunciato sulla rivista Clinical Chemistry l'efficacia di CoVarScan, rivelatosi utile per capire in fretta con quale ceppo di virus si è infettato un paziente. È risultato efficace con Delta, Mu, Lambda, Omicron e Omicron 2. Le analisi hanno coinvolto 3544 soggetti positivi

Palermo, sequenziamento del genoma del Covid 19 all'istituto d'igiene del Policlinico

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Dagli Stati Uniti arriva CoVarScan, test Covid capace di rilevare in poche ore le varianti del virus presenti nell’organismo dei soggetti positivi. Ad annunciare la sua sicurezza ed efficacia sulla rivista medica Clinical Chemistry sono stati i ricercatori dell'UT Southwestern Medical Center di Dallas, Texas

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Transmission electron micrograph of a SARS-CoV-2 virus particle (UK B.1.1.7 variant), isolated from a patient sample and cultivated in cell culture. The prominent projections (red) seen on the outside of the virus particle (blue) are spike proteins. This fringe of proteins enables the virus to attach to and infect host cells and then replicate. Image captured at the NIAID Integrated Research Facility (IRF) in Fort Detrick, Maryland.

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Il team di scienziati spiega che il test nasce dall’esigenza di riconoscere rapidamente quale variante Covid abbia infettato un paziente, per poter così costruire la terapia di cura sulle specificità di ogni ceppo

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La sorveglianza sulle varianti, continuano i ricercatori, è solitamente affidata al sequenziamento del genoma completo, metodo dall’alta affidabilità che richiede però finanziamenti non accessibili a tutti, grande esperienza biotecnica e macchinari specifici

Coronavirus, lo speciale di Sky TG24

05 January 2022, Mecklenburg-Western Pomerania, Greifswald: Technical assistant Claudia Wiede prepares sequencing samples for investigations of corona samples in the laboratory for corona variants (CoMV gene) at Greifswald University Medical Center. Here, new variants and mutations of the corona virus are being searched for. Researchers in Greifswald are working at full capacity and have sequenced more than 1,500 samples in recent weeks. Photo: Jens Büttner/dpa-Zentralbild/dpa (Photo by Jens Büttner/picture alliance via Getty Images)

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CoVarScan si appoggia a un tipo di analisi che separa frammenti del virus, evidenziandoli con colori fluorescenti (multiplex fragment analysis) tramite tecnica PCR, quella tipica dei tamponi molecolari

Long Covid, tre dosi di vaccino proteggono contro tutte le varianti

Respiratory device at the Cochin Hospital in the Covid-19 coronavirus area on the New Year Eve, in Paris, on December 31, 2021.

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Da circa un anno il team di ricercatori, guidato dal patologo Jeffrey Sorelle, ha lavorato per sviluppare e perfezionare CoVarScan. Le analisi sono riuscite a identificare e differenziare le varianti Delta, Mu, Lambda, Omicron e Omicron 2, utilizzando campioni di materiale prelevato da 3544 pazienti Covid

Covid, Omicron 5 è più contagiosa: infezione e sintomi

Roma,Al via, per la prima volta al mondo,presso il Drive In del Policlinico Universitario Campus Bio-Medico,il primo progetto di ricerca per la rivelazione del Covid 19, grazie a dei cani addestrati e messi alla prova con dei test molecolari prelevati su un campione di mille pazienti

Pictured : Unita' Laboratorio analisi del Policlinico Universitario Campus Bio-Medico Covid 19

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Il test, per riconoscere le varianti, separa otto diverse parti del virus che solitamente differiscono tra i vari ceppi. Rileva le piccole mutazioni in cui varia la sequenza dei blocchi costitutivi dell'RNA e misura la lunghezza delle regioni genetiche ripetitive che tendono a crescere e ridursi con l'evoluzione del Covid

Varese,Italy ASST Sette Laghi
Procedura di ricerca nel laboratorio di microbiologia guidata dal Prof.Fabrizio Maggi e la sua equipe durante la ricostruzione del genoma del nuovo virus con il sequenziamento dell'intera strumentale dell'intera proteina spike,la parte del Sars CoV-2
In the photo:momenti del processo di analisi e identificazione virus

Il metodo è basato sulla reazione a catena della polimerasi (PCR), tecnica utilizzata dalla maggior parte dei laboratori di patologia, per copiare e misurare l’RNA, che costituisce il genoma del virus

05 January 2022, Lower Saxony, Hanover: A biological-technical assistant shows prepared PCR tests for the Corona virus from patients in the PCR laboratory of the Lower Saxony State Health Office (NLGA). Photo: Julian Stratenschulte/dpa (Photo by Julian Stratenschulte/picture alliance via Getty Images)

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Focalizzandosi su otto diversi segmenti specifici, il test è risultato particolarmente valido, con il 96% di sensibilità e il 99% di specificità

04 March 2021, Baden-Wuerttemberg, Heidelberg: Vladimir Benes, Head of Genomics Core Facility, takes a container out of a cabinet in a sequencing laboratory at the European Molecular Biology Laboratory (EMBL). In the lab, positive SARS-CoV-2 samples are systematically screened for alterations. The aim is to rapidly identify mutations that pose a particular risk in terms of transmissibility, disease severity and vaccine efficacy. Photo: Uwe Anspach/dpa

Critica comune a questo tipo di test, spiega Sorelle, è che richiede “un adeguamento costante per le nuove varianti”. CoVarScan non ha però “avuto bisogno di alcun adeguamento in più di un anno, sta ancora funzionando molto bene"